微生物鑒定中的生理生化試驗代謝，在所有活細胞中存在的全部生物化學(xué)反應(yīng)稱之為代謝，代謝過程主要是酶促反應(yīng)過程。各種微生物具有不同的酶系統(tǒng)，利用的底物不同，或雖利用相同的底物但產(chǎn)生的代謝產(chǎn)物不同，因此可以利用各種生理生化反應(yīng)來鑒別不同的細菌，尤其是在腸桿菌科細菌的鑒定中，生理生化試驗占有重要的地位。

   常用的微生物生理生化反應(yīng)方法有大分子物質(zhì)水解試驗、糖發(fā)酵試驗、吲哚、甲基紅、伏-普、檸檬酸鹽試驗等多種。

    微生物生理生化鑒定現(xiàn)多用微生物微量發(fā)酵管，其操作方法是將微量發(fā)酵管一端距離內(nèi)容物上方2 cm處用砂輪劃開，并迅速將劃開處置于酒精燈火焰處消毒，無菌操作勾取斜面保存的菌株接入發(fā)酵管中，然后用無菌膠布封口，利用恒溫培養(yǎng)箱培養(yǎng)并觀察結(jié)果。根據(jù)實驗結(jié)果的不同，從而鑒定出不同的微生物種類。

但傳統(tǒng)方法存在以下缺點：

（1）反復(fù)勾取菌種易污染原菌株。

（2）反復(fù)灼燒接種環(huán)，酒精、接種環(huán)損耗嚴重。

（3）實驗耗時長，尤其是當需鑒定的發(fā)酵管達20～30種時。

（4）每次的接菌量不確定，時多時少，易產(chǎn)生實驗誤差。

（5）操作繁瑣，耗費時間較長。