穩定轉染，即進入細胞的質粒整合入細胞基因組中，并能隨細胞分裂穩定傳遞下去。這是相對瞬時轉染而言的。

瞬時轉染的表達時間短暫，外源基因導入整合基因組的幾率非常低，絕大部分以游離形式存在，不能隨細胞分裂而一同復制，導致后拷貝數被稀釋，無法達到持續表達外源基因的目的。一般用轉染試劑進行質粒轉染，多為瞬時轉染。

一般如下情況需要構建穩定株：

1) 長期在目的細胞中研究基因功能，通過構建穩定株，可以大大降低頻繁轉染或者病毒包裝的成本，也極大方便實驗研究；

2)部分蛋白半衰期極長，瞬時RNA只能干擾表達，無法去除已經表達的目的蛋白，通過構建穩定株可以實現好的基因干擾效果；

3)瞬轉往往會引入極高拷貝數的表達，導致因為人為因素造成實驗結果的不，構建穩定株可以幫助篩選拷貝數適量的細胞進行實驗研究；

4)需要用誘導表達系統的，主要是一些致死基因或者是需要時空表達的；

5)需要用細胞做動物實驗的，比如裸鼠成瘤等，往往需要構建成穩轉株。

構建穩定株的方法：

其實用脂質體轉染、磷酸鈣轉染法等理論上是可以構建穩定株的，但這些方法整合入基因組的效率極低，很難成功。而慢病毒可以攜帶外源基因隨機整合進基因組，效率很高，是建立穩定株的優方式。

構建穩定株的注意點：

穩定株構建是個長期過程，從質粒構建到慢病毒包裝，再到細胞感染及后期的篩選，每一步都至關重要，所以建立穩轉株花個半年時間，也是常有的事，而且要承擔病毒包裝不成功，細胞感染效率低等風險。